Vjerovatno je početkom 16. vijeka u regiji današnjeg Guanajuata živjela autohtona Chichimecas, uglavnom mjesto zvano Paxtitlán, gdje je bilo puno žaba.
Očito su Taraskanski Indijanci koji su ih pratili dali ime Quanashuato, "planinsko mjesto žaba". Poznato je da su Španci do 1546. godine već istražili to područje i da je Rodrigo Vázquez osnovao ranč. Između tog datuma i 1553. godine došlo je do važnih otkrića nalazišta minerala zlata i srebra, a najznačajnije je to učinio Juan de Rayas 1550. Do sljedeće godine u tom su se mjestu smjestila četiri logora ili kraljevske porodice za brigu o novootkrivenim rudnicima. , među njima najvažniji pod nazivom Santa Fe.
Iako su Chichimecas napadali s određenom učestalošću, Real de Minas podignut je kao ured gradonačelnika 1574. godine, usvojivši ime Villa de Santa Fe u Real y Minas de Guanajuato. 1679. godine već je imao blazonu ili grb, a 1741. godine dobio je titulu grada zbog „povoljnih pogodnosti koje nude bogati rudnici srebra i zlata“. Kralj Felipe V potpisao je Potvrdu i nazvao je vrlo plemenitim i odanim Kraljevskim gradom Minas de Santa Fe de Guanajuato.
Ova lokacija natjerala je na razvoj koji je utvrdio određene urbane karakteristike koje su nastale uslijed topografskih nepravilnosti terena, prilagođavajući raspored naselja na njega i crtajući osebujne ulice, trgove, trgove, uličice i stepeništa izvanrednog izgleda, okolnost koja je vrijedna grad koji se smatra jednim od najdivljenijih u našoj zemlji.
U početku su ga činile četiri četvrti: Marfil ili Santiago, Tepetapa, Santa Ana i Santa Fe; Smatra se da je potonji bio najstariji i da se nalazio tamo gdje je sadašnja četvrt La Pastita. Urbana integracija uključivala je i potok koji je praktično prošao kroz središte naselja, pretvarajući ga u Calle Real, koja je bila glavna osovina grada i na čijim su se stranama, na padinama strmih brežuljaka, gradile kuće njegovih stanovnika. Ova ulica, danas poznata kao Belaunzarán, jedna je od najljepših avenija za podzemne dijelove, mostove i ugodne kutove koje čini na svojoj vijugavoj ruti. Najvažnije i najbogatije konstrukcije izrađene su u ružičastom kamenolomu, dok su za skromnije korištene ćerpič i pregradni zidovi, aspekt koji mu je davao karakterističnu boju koja se kreće od crvenkastih do zelenih tonova, prolazeći kroz ružičaste; slojevita zemljana posuda korištena je za kolnike, stubišta i fasete.
Bogatstvo koje je grad postigao prema 18. stoljeću, zahvaljujući bogatim naslagama zlata i srebra, očitovalo se u njegovoj civilnoj i vjerskoj arhitekturi; Međutim, potrebno je imenovati, na primjer, prvu kapelu, blagoslovljenu 1555. godine, a to je bila bolnica de los Indios Otomíes, oratorij Colegio de Compañía de Jesús, osnovan oko 1589. godine, koja se nalazila tamo gdje su danas Sveučilište i primitivna župna crkva. pod nazivom Bolnice, datiraju iz sredine šesnaestog vijeka, a danas su djelomično modificirane i imaju gravuru na pročelju s likom Gospe od Guanajuato.
Grad nudi prostore s izvanrednim ambijentom i lijepim perspektivama, sa svojim trgovima koji uokviruju zgrade od najvećeg interesa, poput San Francisca, gdje završava ulica Sopeña, ispred hrama u San Franciscu, s baroknom fasadom 18. stoljeće koje je u suprotnosti sa susjednom kapelom Santa Casa. Dalje je vrt Union, na čijoj se južnoj strani nalazi čudesni hram San Diega, koji je nekada imao stari samostan; hram je oštećen poplavom, a obnovljen je u 18. stoljeću intervencijom grofa Valenciane. Fasada joj je u baroknom stilu sa kuririški zrakom.
Kasnije je Plaza de la Paz, okružena zanimljivim zgradama poput Vladine palače, izvanredne Kuće grofova Rul, djela s kraja 18. stoljeća pripisanog arhitekti Franciscu Eduardu Tresguerrasu, koje ima izvrsnu fasadu i prekrasan vrt. iznutra; kuća grofa Gálveza i kuća Los Chico. Na istočnom kraju trga nalazi se impozantna bazilika Nuestra Señora de Guanajuato, sagrađena u sedamnaestom stoljeću u trezvenom baroknom stilu, u kojoj se u glavnom oltaru nalazi dragocjena slika Gospe od Santa Fe de Guanajuato. Iza bazilike nalazi se još jedan trg koji prethodi raskošnom hramu Družbe Isusove, sagrađenom 1746. godine uz podršku don Joséa Joaquina Sardanete y Legazpija. Zgrada ima jednu od najljepših baroknih fasada u Meksiku i ističe se kolosalna kupola koju je u prošlom stoljeću dodao arhitekta Vicente Heredia. Na zapadnoj strani ovog hrama nalazi se kampus Univerziteta, koji je bio Colegio de la Purísima koji su osnovali jezuiti krajem 16. vijeka; zgrada je pretrpjela modifikacije u 18. stoljeću, a neke i sredinom ovog stoljeća. Prema istoku Kompanije nalazi se Plaza del Baratillo, koja se može pohvaliti prekrasnom fontanom koju je iz Firence donijela naredba cara Maximiliana, a na zapadnoj strani stoji hram San José.
Nastavljajući ulicom Juárez, prolazite pored Zakonodavne palače, građevine iz 19. vijeka; dalje je zgrada koja je nekada bila Kraljevska kuća iskušenja, izvanredna barokna vila s prvim plemenitim grbom u gradu na pročelju. Odatle, mala poprečna ulica prolazi kroz Plaza de San Fernando da bi stigla do Plazuele de San Roque, šarmantnog kolonijalnog kutka koji uokviruje istoimenu crkvu i koja je najstarija sačuvana, sagrađena 1726. godine. Kompleks zauzvrat daje pristup ugodnom vrtu Morelos, koji prethodi hramu Belén, građevini iz 18. stoljeća sa skromnim portalom i prekrasnim oltarnim pločama u sebi. S jedne strane hrama, ulica koja ide prema sjeveru vodi do zgrade Alhóndiga de Granaditas; Zamišljena za skladištenje žita i hrane, njena gradnja započela je 1798. godine prema projektu arhitekte Durán y Villaseñor, a završio je 1809. godine pod nadzorom Joséa del Maza. Njegova opšta slika prekrasan je uzorak neoklasične građanske arhitekture Meksika.
Tipični prostori grada su trgovi i uličice, među kojima možemo spomenuti plazuelu de la Valenciana, Los Ángeles, Mexiamora, poznati i romantični Callejón del Beso i Salto del Mono. Ostale važne vjerske građevine su hram Guadalupe, sagrađen u 18. stoljeću u trezvenom baroknom stilu, hram El Pardo, također iz 18. vijeka, s fasadom punom biljnih motiva majstorski izvedenim u kamenolomu.
Izvan Povijesnog centra, na sjeveru, nalazi se hram Valenciana posvećen San Cayetanu, čija se izvrsna churrigueresque fasada iz 18. vijeka uspoređuje s onom Sagrario i Santísima u Mexico Cityju. Hram je sagrađen na zahtjev don Antonija de Obregón y Alcocera, prvog grofa Valencije, između 1765. i 1788. godine. Ograđeni prostor čuva nekoliko sjajnih oltarskih slika i dragocjenu minbernu obloženu kostima i dragocjenim drvetom. Hram Cata takođe zaslužuje posebnu pažnju. Podignut ispred trga danas poznatog kao Don Kihot, još je jedan od izvrsnih primjera meksičkog baroka, čija se fasada poklapa s Valencianom. Smješteno je u istoimenom rudarskom gradu, a njegova gradnja datira iz 17. vijeka.
