Milijuni godina poluotok Jukatan pojavio se iz mora kao krečnjačka stijenska ploča na kojoj je postojanje rijeka praktično nemoguće.
Kasnije, tokom hiljada godina, kiša kljuca ovu ogromnu stijenu i voda prodire u podzemlje, gdje tvori prave kanale koji zauzvrat probijaju najdublje slojeve. Cenoti su upravo rezultat ovog procesa; Nastaju kada je voda podzemlja izložena urušavanju šupljina stvorenih podzemnim strujama.
Postoje mali cenoti s vodenim zrcalom gotovo u nivou tla, ili vrlo veliki, s visokim "pucnjem" između tla i vode. Baš kao što su bili i danas izvor opskrbe stanovništva stanovništvom, u prošlosti su se smatrali prebivalištem bogova vode, i, prema tome, predmetom obožavanja i štovanja.
Izvor: Saveti iz Aeroméxica br. 16 Quintana Roo / leto 2000