Povijest grada koji se prvobitno zvao Kraljevina Nova Galicija nastavlja se.
Tu je i stari jezuitski koledž Santo Tomás de Aquino, izgrađen u posljednjoj deceniji 16. vijeka i koji je 1792. godine zauzelo Sveučilište. Od konstrukcije je ostalo samo ono što je bila crkva sa monumentalnom kupolom iz prošlog vijeka i pripadajućom kapelom Loreto, koju je 1695. sagradio Juan María de Salvatierra. Hram San Juan de Dios, koji je nekada bila kapela Santa Veracruz, sagradio ga je u 16. stoljeću don Pedro Gómez Maraver, sagrađen je u 18. stoljeću s baroknom fasadom trezvenih karakteristika. Crkvu La Merced, sa baroknim stilom sličnim onom u San Juan de Dios-u, iako više ukrašen, osnovali su u 17. stoljeću fratri Miguel Telmo i Miguel de Albuquerque.
Hram La Soledad izgrađen je krajem 17. i početkom 18. vijeka na zahtjev Juane Romane de Torres i njenog supruga, kapetana Juana Bautiste Pandura. Na mjestu je bilo bratstvo Gospe od Samoće i Svetog groba, zauzimajući kapelu posvećenu San Franciscu Xavieru. Hram i škola u San Diegu, djelo XVII vijeka; prvi s vrlo trijeznim vratima koji već izgleda pripadaju neoklasičnom stilu, a drugi s prekrasnom arkadom koja krasi njegov stari klaustar.
Crkva Jesús María, pripojena istoimenom samostanu, osnovana je 1722. godine; još uvijek čuva svoje barokne fasade, na kojima možete vidjeti velike skulpture koje predstavljaju Sagrada Familia, Virgen de la Luz, San Francisco i Santo Domingo.
Na kraju, važno je istaknuti još tri religiozne građevine koje su se pojavile kao najbolji primjeri, svaki od svoje vrste, razvoja kolonijalne arhitekture u Guadalajari, uglavnom između sedamnaestog i osamnaestog vijeka. Tako imamo kapelu Aránzazu, sredinom 18. vijeka, sa svojim znatiželjnim zvonikom i unutrašnjošću ukrašenom veličanstvenim slikama i oltarskim slikama Churrigueresque iz istog razdoblja i koja se smatra najboljom u gradu. Samostan i crkva Santa Mónica, koju je osnovao otac Feliciano Pimentel u prvoj polovini 18. vijeka; njegov hram ima dvostruku fasadu sa bogatom ornamentikom koja je klasifikovana kao najbolji primjer bujnog solomonskog baroknog stila. Hram San Felipe Neri, sagrađen 1766. godine od strane arhitekte Pedra Ciprésa, čini skup izvanredne prisebnosti koji u svoje ukrase uključuje elemente s platereskim podsjećanjima, aspekt koji postavlja hram kao najbolju vjersku građevinu u Guadalajari.
U građevinama koje odgovaraju civilnoj arhitekturi postoje neke vrijedne građevine, među kojima možemo spomenuti Vladinu palaču, stare kraljevske kuće koje su modificirane u 18. stoljeću prema projektu vojnog inženjera Juana Francisca Espina, iako je fasada bila djelo Miguela Joséa Coniquea. Zgrada je u osnovi zamišljena u baroknom stilu, ali u njoj se već primjećuju određene neoklasične tendencije. Kraljevski uredi, koji su bili u ugašenom Palacio de Medrano, i prostorije za publiku radile su u prostorijama.
Imamo i ono što je bilo Saborno sjemenište posvećeno San Joséu, koje je biskup Galindo y Chávez otvorio 1701. godine, a danas ga zauzima Regionalni muzej Guadalajare, sa svojim glavnim klaustrom u stupcima u toskanskom stilu i baroknim vratima. Čuveni Hospicio Cabañas sagrađen početkom 19. vijeka, slijedeći planove slavnog arhitekte Manuela Tolse, režirajući djelo Joséa Gutiérreza, a godinama kasnije dovršen od strane arhitekte Gómeza Ibarre, i koji predstavlja zapažen primjer neoklasičnog stila.
Između ostalih manjih građevina koje su pružale stilsko jedinstvo gradu Guadalajari, možemo spomenuti, iako nisu sve sačuvane: velebni dvorac iz 16. stoljeća koji je stajao ispred nekadašnjeg trga San Sebastián u četvrti Analco. Kuća na Calle de la Alhóndiga br. 114, trenutno Pino Suárez. Rezidencije koje su pripadale porodici Sánchez Leñero na 37. mjestu i gospodina Dionisia Rodrígueza na 133 na Calle de Alcalde. Kuća Calderón, tradicionalna kolonijalna prodavnica slatkiša osnovana 1729. godine i smeštena na uglu starih ulica Santa Teresa i Santuario, danas Morelos i Pedro Loza; onaj Francisca Velardea, u neoklasičnom stilu, i na kraju onaj koji je bio dvorac Cañedo, smješten ispred stražnjeg dijela Katedrale.
U blizini Guadalajare, trećeg po važnosti grada u državi, nalazi se stari grad San Juan Bautista Melzquititlán, danas San Juan de los Lagos. Ovaj grad je postao važno vjersko središte zbog velike čudesne tradicije lika Djevice Marije koja čuva svoju baziliku, koju je sredinom 17. stoljeća sagradio don Juan Rodríguez Estrada. U istom gradu možete vidjeti i druge građevine kao što su Hram Trećeg reda, Kapela na Kalvariji, Kapela Prvog Čuda iz 17. i 18. vijeka. Postoje i važne civilne zgrade među stanovništvom, kao što su Palata koledža i zgrada Desetine, između ostalog.
U gradu Lagos de Moreno možete vidjeti njegovu glavnu župu, djelo iz 17. stoljeća s prekrasnom fasadom u Churrigueresque stilu.
Konačno, u San Pedro Tlaquepaque ima nekoliko primjera barokne religijske arhitekture u regiji, poput župe San Pedro i hrama Soledad.
